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Parallelization of Queries on Genomic Data - Miroslav Cupak
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Miroslav Cupak:
Parallelization of Queries on Genomic Data - Taschenbuch

2015, ISBN: 3659684880

ID: 22516933346

[EAN: 9783659684883], Neubuch, [PU: LAP Lambert Academic Publishing Apr 2015], Neuware - Recent progress in bioinformatics and especially high-throughput sequencing has enabled us to sequence and analyze genomes of many individuals, which can lead to improved diagnostics and treatment for patients suffering from genetic diseases. To achieve this, tools used in both clinical and research environments need to be enhanced to handle large amounts of data. This book analyzes application-level parallelization of database query processing by means of sharding as a technique for improving performance and scalability of an open-source search engine for genomic variants. We describe the challenges of designing and implementing a data access layer, the core of which is a general sharding framework. The approach allows for utilization of multiple processors as well as machines when querying the underlying data. This enables the system to scale in a near-linear fashion as more servers are added, with many queries achieving even superlinear speedup. This book should be useful to software engineers and scientists interested in an intriguing problem in the area of parallelization as well as anyone curious about what happens under the hood of modern genome analysis systems. 132 pp. Englisch

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Parallelization of Queries on Genomic Data - Miroslav Cupak
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Parallelization of Queries on Genomic Data - Taschenbuch

2015, ISBN: 3659684880

ID: 22516905525

[EAN: 9783659684883], Neubuch, [PU: LAP Lambert Academic Publishing Apr 2015], Neuware - Recent progress in bioinformatics and especially high-throughput sequencing has enabled us to sequence and analyze genomes of many individuals, which can lead to improved diagnostics and treatment for patients suffering from genetic diseases. To achieve this, tools used in both clinical and research environments need to be enhanced to handle large amounts of data. This book analyzes application-level parallelization of database query processing by means of sharding as a technique for improving performance and scalability of an open-source search engine for genomic variants. We describe the challenges of designing and implementing a data access layer, the core of which is a general sharding framework. The approach allows for utilization of multiple processors as well as machines when querying the underlying data. This enables the system to scale in a near-linear fashion as more servers are added, with many queries achieving even superlinear speedup. This book should be useful to software engineers and scientists interested in an intriguing problem in the area of parallelization as well as anyone curious about what happens under the hood of modern genome analysis systems. 132 pp. Englisch

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ISBN: 9783659684883

ID: 711121888

Parallelization of Queries on Genomic Data: Miroslav Cupak Parallelization of Queries on Genomic Data: Miroslav Cupak Bücher > English, International > Gebundene Ausgaben, LAP Lambert Academic Publishing

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ISBN: 9783659684883

ID: 821572828

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Parallelization of Queries on Genomic Data - Cupak Miroslav
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Cupak Miroslav:
Parallelization of Queries on Genomic Data - Taschenbuch

2015, ISBN: 3659684880

ID: 21122394241

[EAN: 9783659684883], Neubuch, [PU: LAP Lambert Academic Publishing], This item is printed on demand for shipment within 3 working days.

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Details zum Buch

Detailangaben zum Buch - Parallelization of Queries on Genomic Data


EAN (ISBN-13): 9783659684883
ISBN (ISBN-10): 3659684880
Gebundene Ausgabe
Taschenbuch
Erscheinungsjahr: 2016
Herausgeber: OmniScriptum GmbH & Co. KG

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ISBN/EAN: 9783659684883

ISBN - alternative Schreibweisen:
3-659-68488-0, 978-3-659-68488-3


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